Родился в Москве. В 1981 году окончил Московский автомобильно-дорожный институт по специальности «Инженер-строитель».
Трудовую деятельность начал инженером в Государственном проектно-изыскательском и научно-исследовательском институте гражданской авиации «Аэропроект», где проработал двадцать девять лет.
В качестве главного инженера проектов руководил и непосредственно участвовал в подготовке и разработке проектов строительства и реконструкции многих крупных аэродромов и аэропортов на территории Российской Федерации, в том числе аэропортов Домодедово, Владикавказа, Грозного, Махачкалы, Нальчика, Минеральных Вод,Ростова-на-Дону, Волгограда, Оренбурга, Иркутска, а также вертодромов Южной Осетии.
В 2011 году перешел на работу в Главгосэкспертизу России. В ноябре 2011 года Ваису Хайрулловичу присвоен, а в январе 2017 года продлен статус «Государственного эксперта» по направлению деятельности «Воздушный транспорт».
Награжден Почетными грамотами Председателя Правительства Российской Федерации, Министерства строительства и жилищно-коммунального хозяйства Российской Федерации, Главгосэкспертизы России. За время работы в Главгосэкспертизе России Ваис Якубов рассмотрел проектную документацию по реконструкции и строительству объектов авиационной инфраструктуры аэропортов Домодедово, Шереметьево, Внуково, Пулково, Емельяново, Туношна, Воронеж, Бесовец, Итуруп, а также аэропортов и аэродромов Минеральных Вод, Махачкалы, Анапы, Иркутска, Саратова, Владикавказа, Магадана, Казани, Белгорода, Ростова-на-Дону, Кирова, Грозного, Калуги, Нижневартовска, Уфы.